Организационная структура ассоциации «Братья-мусульмане» стала воплощением видений, принципов и идеологических основ, которые легли в основу основного послания основателя Хасана Аль-Банны, в котором подчеркивается идея инклюзивной ассоциации, которая по своей сути является «салафитским призывом, суннитским путем, суфийской истинной, политической организацией, социальной идеей, спортивной командой, научно- культурным обществом и хозяйственной компанией». Данная структура со своими институциональным, организационным и административным функционалом соответствовала целями и задачам ассоциации и стремилась воплотить их в реальность, как в самом Египте, так и за его пределами, особенно в том, что касается концепции «возрождения халифата и всемирного лидерства».